SOAL PRAKTIK OSN (Bioinformatika (Biologi Komputasi Tumbuhan)

PETUNJUK:  KERJAKAN SOAL DI BUKU CATATAN

INGAT:  Jangan buru buru melihat pembahasan atau AI dalam mengerjakan soal.  biarkan otakmu bekerja terlebih dahulu (berpikir, mengingat, dan mereview kembali materi pelajaran yang pernah anda lalui ) buka pembahasan, kunci jawaban, atau gunakan AI hanya saat anda betul betul belum tahu atau jika materi tersebut belum pernah disampaikan. 

SOAL 1 

Hit terbaik:

  • A: E = 1e-50, identity 95%
  • B: E = 1e-20, identity 98%

A. A
B. B
C. Sama
D. Tidak valid
E. B karena identity

SOAL 2 (ORF)

ORF panjang tanpa stop codon berarti…

A. Non-coding
B. Gen aktif
C. Rusak
D. RNA
E. Intron

SOAL 3 (Alignment Konservatif)

Residue konservatif menunjukkan…

A. Tidak penting
B. Situs aktif
C. Mutasi
D. Intron
E. Random

SOAL 4 (Bootstrap Tree)


Bootstrap 95% berarti…

A. Mutasi tinggi
B. Kepercayaan tinggi
C. Evolusi cepat
D. Salah
E. Random

SOAL 5 (RNA-seq Normalisasi)

Normalisasi diperlukan untuk…

A. Menghapus gen
B. Membandingkan sampel
C. Mengubah DNA
D. Menghapus noise
E. Mengubah protein

SOAL 6 (Clustering Gen)


Gen dalam cluster sama berarti…

A. Tidak terkait
B. Fungsi sama
C. Tidak aktif
D. Rusak
E. Random

SOAL 7 (SNP Coding)

SNP mengubah asam amino disebut…

A. Silent
B. Missense
C. Nonsense
D. Frameshift
E. Neutral

SOAL 8 (Genome Duplication)

Efek utama duplikasi genom adalah…

A. Gen hilang
B. Variasi meningkat
C. DNA rusak
D. Evolusi berhenti
E. Protein hilang


SOAL 9 (Promoter)

TATA box berfungsi…

A. Terminasi
B. Inisiasi transkripsi
C. Translasi
D. Replikasi
E. Mutasi

SOAL 10 (Protein Homologi)

Homologi tinggi berarti…

A. Fungsi beda
B. Struktur mirip
C. Tidak terkait
D. Rusak
E. Tidak aktif


SOAL 11 (Gene Ontology)

Gene Ontology menjelaskan…

A. DNA
B. Fungsi gen
C. Mutasi
D. Energi
E. Protein

SOAL 12 (Fold Change)

Fold change tinggi berarti…

A. Tidak berubah
B. Perbedaan ekspresi besar
C. Rusak
D. Tidak aktif
E. Tidak penting


SOAL 13 (Jarak Genetik)

Jarak besar berarti…

A. Dekat
B. Jauh
C. Sama
D. Tidak berubah
E. Tidak relevan


SOAL 14 (Motif DNA)

Motif konservatif berarti…

A. Random
B. Regulasi penting
C. Rusak
D. Tidak aktif
E. Mutasi


SOAL 15 (Alignment Score)

Skor tinggi berarti…

A. Berbeda
B. Mirip
C. Rusak
D. Mutasi
E. Tidak relevan


Skor tinggi = banyak kesamaan sekuens.

SOAL 16 (Isoform)

Isoform terjadi karena…

A. Mutasi
B. Alternative splicing
C. Replikasi
D. Translasi
E. Degradasi


SOAL 17 (Integrasi Omics)

Tujuan integrasi omics adalah…

A. Menghapus data
B. Memahami sistem biologis
C. Mengurangi gen
D. Menghapus protein
E. Mengubah DNA


SOAL 18 (Network Biology)



Node dengan banyak koneksi adalah…

A. Tidak penting
B. Hub gene
C. Mutasi
D. Rusak
E. Tidak aktif


SOAL 19 (Clustering ML)

Clustering termasuk…

A. Supervised
B. Unsupervised
C. Reinforcement
D. Random
E. Tidak ada


SOAL 20 (Integratif Ekstrem)

Gen dengan konservasi tinggi + ekspresi tinggi →

A. Tidak penting
B. Gen esensial
C. Mutasi
D. Tidak aktif
E. Junk